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科学家发明环形DNA测序工具

加拿大艾伯塔大学(University of Alberta)的生物学家发明了一种为环形DNA测序的工具,将为病毒、农作物和癌症的研究,提供更准确数据。

环形DNA测序示意图。Devang Mehta/ University of Alberta

研究人员将工具发布在网上,并附有在实验室和电脑上测序操作的步骤说明,供世界各地同行使用。

环形DNA在细菌和病毒中很常见。最近,科学家在人体和植物细胞核内也发现了这种DNA,也称为染色体外环状DNA(eccDNA)。

研究负责人梅塔(Devang Mehta)说,科学家对这类型的DNA了解有限,现在发现它们在癌细胞中也常见,可能和癌细胞快速繁殖的能力相关。

科学家开始调查这种DNA在癌细胞内所扮演的角色,但缺乏对其研究和测序的高效工具。

梅塔说:“我们设计了一套新的分子生物学方法和一种新的生物信息学算法,终于可以获得整套eccDNA信息。我们的方法让我们能够对这些分子完整测序,给予我们和其他研究人员更好的细胞研究工具。”

梅塔特别提到,这个工具可能对农业科学家很有帮助,因为很多感染农作物的病毒都具有环形DNA。

这份研究近期发表在《自然-实验室指南》(Nature Protocols)上。

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